Одсјек за хигијену и здравствену екологију је задужен за откривање, праћење и превенцију фактора ризика по здравље од заразних и хроничних незаразних болести као и за предузимање мјера за смањење њиховог утицаја или елиминисање.
Главне дјелатности Одсјека хигијене и здравствене екологије су :
Праћење и анализа квалитета здравствене безбједности вода (за пиће и вода за рекреацију и базене,) , намирница и брисева.
Праћење санитарно - хигијенских и других услова у јавним објектима, образовно-васпитним установама као и објектима за производњу и промет животних намриница
Праћење хигијенских и других услова под којима становништво живи и ради као могућих узрочника болести и предлагање мјера за решавање проблема из области хигијене и здравствене екологије.
Активности Одсјека за хигијену и здравствену екологију су:
-Узорковање
Стручни тим, осим љекар, специјалисти хигијене сачињавју и санитарно еколошки инжењери и санитарни техничари који врше узорковање: вода за пиће,вода за рекреацију и спорт (базени - отворени и затворени, јавна купалишта)намирница,брисева. Сви запослени су потпуно стручно оспособљени за сва наведена узорковања, која се обављају према важећој законској регулативи и домаћим и међународним стандардима. Узорковања се врше за потребе различитих корисника (јавна комунална предузећа, индустријска производња, занатска производња, промет хране, обданишта, основне школе, интернати, студентски домови, здравствене установе
-Давање стручног мишљења
-Праћење санитарно-хигијенског стања у образовно- васпитним установама
- Спровођење дијето-профилактичких мјера
